Das einst so machtige Rom liegt in Trummern. In der Stadt herrschen Elend und Zerfall und ihre Bewohner vegetieren im Schatten der machtigen Borgia-Familie. Die letzte Hoffnung der ewigen Stadt ist nun Ezio Auditore - der Meisterassassine. Doch ihn erwartet ein erbarmungsloser Gegner. Cesare Borgia - ein Mann der noch ruchloser und brutaler vorgeht als sein Vater der Papst -, wird keine Ruhe geben...